移植不成功后胚胎会被机体吸收，或者随着下次月经排出体外。一般不会出现明显的不适感，部分患者因自身体质的原因，会出现少量的阴道出血及腹痛的情况，属于正常的现象。胚胎移植失败的原因有很多，主要是染色体异常，子宫内膜过厚或过薄，周围环境及自身免疫因素引起。
在胚胎移植不成功后，建议进行系统的检查，明确失败的原因，在医生指导下对症治疗。避免过度失望、焦虑，放松心情。调整饮食结构，合理运动，将身体调整至最佳状态后再进行胚胎移植。
胚胎移植成功率取决于胚胎质量和子宫内环境。一般来说，胚胎移植的成功率大概在50%左右。按胚胎的质量来分，可分为4个等级，一级、二级胚胎外观规整，细胞分裂数目恰当，且大小均匀，碎片少，属于优质胚胎，移植一级、二级胚胎一般都是没问题的。三级胚胎质量要差很多，发育潜力较弱，也可以移植，但四级胚胎质量太差，不具备发育能力，一般都要求放弃移植。建议夫妻双方放平心态，理性看到胚胎移植成功率的问题，女性在移植前注意多休息，保证充足的睡眠时间，多吃高蛋白的食物，听从医生的安排即可。
如果说试管婴儿胚胎移植了，只要成功最早大约7天就可以通过验血hcg测出来，移植后10天左右通过尿液早孕试纸测出是否怀孕，如果移植的是第5天或第6天的囊胚，还会提早两天。
如果没有特殊情况，没必要测那么早，因为每个人胚胎着床时间有早有晚，有人可能胚胎着床时间比较晚，早测不一定能测出阳性的结果，反而增加焦虑、抑郁等不良情绪的产生，对胚胎发育会有不利的影响。大部分试管移植后没有明显的临床症状，有些在试管着床后出现阴道少量出血，可能会在胚胎移植的过程中伤及子宫蜕膜小血管，往往具有自限性。试管着床成功后可能会发生早孕反应，主要有乳胀、干呕、乏力、嗜睡、头晕、腹部轻微不适等。
建议移植后两周到医院做血HCG、雌激素、孕激素的检测，如果这时呈阳性，数值也比较不错，代表胚胎已经种植成功。
