卵黄囊瘤一般都是恶性的，是一种恶化程度极高的生殖细胞癌症。
卵黄囊瘤的生长迅速非常快，且还容易发生早期的转移，对患者身体的危害很大，这些都符合恶性肿瘤的特征。因此它最好是早发现早治疗，太晚比如已经发生转移了，这时候治疗意义已经不大了。
卵黄囊瘤的诊断金标准是组织病理学诊断，这需要先取样，取样方法有手术切除、切取部分肿瘤组织、或者穿刺活检获取肿瘤组织样本，然后再来进行病理诊断。若是无法取样，比如睾丸卵黄囊肿瘤则应根据影像学和肿瘤标记物水平(甲胎蛋白)进行判断。
卵黄囊癌是恶性的，它的治疗要看肿瘤的分期决定。
如果发现是中期期，通过手术配合化疗治疗。可先行化疗，等瘤体明显缩小时再考虑手术切除，手术以后再加强化疗来提高患者生存率。
若发现时已经是晚期了，这是肿瘤已经向远处转移，手术意义不大，只能单纯化疗稍稍延长生命，但化疗的同时还要忍受身体出现恶心、呕吐等很多痛苦。
