这种饮食法有时会和泻药一起使用，导致脱水。虽然这种饮食法补充大量的水份，但也可能使大便长期不成形，或是腹泻不止。若没有及时治疗，甚至危及到生命。
长期食用像柠檬水这类的排毒饮食法，会引起恶心、呕吐，甚至是脱水。呕吐也使身体无法吸收营养。
改变饮食习惯可能影响你的肠道，而柠檬水饮食法可能导致腹部不适或胀气，不仅令人尴尬，还非常痛苦。
大多数的排毒饮食法，会严重破坏你的新陈代谢，使得减肥者尝试正常摄取食物后，反而体重增加，甚至比节食前重。
排毒饮食法副作用是代谢性酸中毒。根据哈佛医学院的说法，若有人持续使用这种饮食法，会破坏酸硷平衡，使血液中的酸度升高，更糟的话可能导致昏迷，甚至是死亡。
