黑小麦中含有丰富硒元素，硒元素具有防癌抗癌，提高人体免疫力，延缓衰老、清除人体的有毒物质，经常食用有机硒食品可以降低重金属对身体的毒害，抑制癌症和肿瘤。
黑小麦中所含的天然色素非常丰富，黑小麦中色素属于花色苷类化合物，属于黄酮类化合物，具有非常良好的抗氧化和防病治病的作用，如清除体内自由基、抗炎抗肿瘤、预防糖尿病及保护视力等等。
黑小麦中膳食纤维含量很高，大约是普通浅色小麦的2-3倍。在预防心脑血管疾病方面具有积极作用，此外黑小麦中含有大量的不饱和脂肪酸，其中亚油酸和亚麻酸的含量都比较高，它们可以分解人体内多余的脂肪，也能清理血液中的胆固醇和多种毒素，能软化血管，加快血液流动，平时多食用一些可以保护血管，减少动脉硬化和血栓等疾病的发生。
黑小麦中含有珍贵的生物活性物质二十八烷醇，。二十八烷醇是医学界和营养界公认的优秀抗疲劳物质，具有多种重要的生物活性作用，尤其具有极其良好的提高体力、耐力和精力的功效，如提高肌肉耐力和反应敏锐性，增强包括心肌在内的肌肉功能，消除肌肉痉挛和提高能量代谢率等。
