红斑性狼疮会攻击身体许多部位，包括关节、皮肤、肾脏、心脏、血管和脑等，尤其最容易侵犯皮肤黏膜、肾脏、关节这叁个器官系统。
有时会先攻击关节，造成关节红肿热痛;有时先攻击肾脏，而出现蛋白尿、全身水肿、甚至急性肾竭症;也有病人被侵犯中枢神经，引发精神问题或认知功能异常。
如果出现长期疲倦、发烧、腹痛、关节痛、皮肤疹、掉头发、肾脏发炎、忧郁、歇斯底里、抽搐痉挛、白血球低、溶血性贫血、一再流产等症状，且经医师诊断后仍然查不出明确病因，就要怀疑是红斑性狼疮。
1. 全身性表现(发生率 95%)：疲倦、发烧、体重减轻。
2. 肌肉骨骼系统(发生率 95%)：关节酸痛、关节炎、肌炎、缺血性骨坏死。
3. 血液系统(发生率 85%)：贫血、白血球低下、血小板低下、脾肿大、淋巴节肿大。
4. 皮肤(发生率 80%)：脸部蝴蝶斑、圆盘性红斑、光敏感、口腔溃疡、掉发、血管炎。
5. 神经系统(发生率 60%)：认知障碍、情绪异常、癫痫、脑血管病变、神经病变。
6. 心血管系统(发生率 60%)：心包膜炎、心内膜炎、肺出血、肺炎、肺动脉高压。
7. 呼吸系统(发生率 60%)：肋膜炎、肋膜积液、肺出血、间质性肺炎、肺出血。
8. 肾脏(发生率 50%)：蛋白尿、肾病症候群、肾衰竭。
9. 肠胃系统(发生率 45%)：肠出血、穿孔、噁心、腹泻、腹水。
10. 眼睛(发生率 15%)：血栓、视网膜血管炎、乾眼症。
11. 血栓(发生率 15%)
血管炎：血管炎是红斑性狼疮的常见併发症之一，如果是内脏血管发炎，则可能造成血管阻塞或出血、脑中风、心肌梗塞。
肾脏炎：肾脏炎也是常见併发症之一，病人会出现下肢水肿、蛋白尿，严重时引发肾功能衰竭，需要洗肾。
中枢神经病变：症状包括昏迷、脑中风、意识障碍、行为错乱、头痛或是忧郁症。
关节炎：攻击滑膜(位于关节腔内，可保护关节软骨)，会造成关节红肿热痛。
系统性红斑狼疮：影响全身许多部位，最常见的一种形式。
圆盘状红斑狼疮：只对皮肤产生影响，病灶呈现红色圆盘状肿块，边缘略为突起，早期呈现红色，晚期病灶会结痂，并会完全破坏毛发中的发根位置，该位置无法在长出毛发。通常病变出现在脸部、头部或耳朵等部位，会因为曝晒阳光而恶化。可以根据发作时间再分为急性、亚急性与慢性。
药物性狼疮：可由药物引起，多半是因为长期服用特定药物，治疗时需要对特定引发药物停药。
新生儿狼疮：新生儿出生没多久就罹患的一种罕见狼疮。
