奇亚籽中含有含有较为丰富的蛋白质、纤维素、脂肪等不易消化的成分，，如果大量服用奇亚籽容易使这些成分堆积在肠道内，增加消化负担，从而可能会引起腹痛、腹胀等消化不良症状。
奇亚籽会在很大程度上降低舒张压的水平，所以，如果本身就是低血压患者，还吃奇亚籽的话，就会让你的舒张压变得更低，故，低血压患者一定要远离这种食物才行。
孕妇和哺乳中的妈妈：由于奇亚籽中的omega 3有降血压的效果，一般怀孕中的妈妈血压比较不稳定，为了宝宝的安全，建议在吃奇亚籽之前先找营养师或医师谘询。
对芝麻、芥菜或薄荷过敏的人：奇亚籽是鼠尾草的种子，和芝麻等植物类似，如果对相关食物有过敏史，很可能对奇亚籽也过敏，须特别小心。
低血压的人：奇亚籽有降血压的功能，如果本身血压就已经很低的人，必须特别小心，以免血压过低。
容易胀气的人：容易胀气的人，表示平常消化道的功能就不太好。由于奇亚籽中含有很多不能被消化的纤维，对一般人来说可以促进肠道蠕动，不过对肠胃不好的人，有可能造成胀气的反效果，须小心食用。
有罹患前列腺癌风险的人：奇亚籽中含有的α-亚麻酸，经临床实验证实，有可能会增加罹患前列腺癌风险。因此本来就属于高风险的族群，在吃奇亚籽时须特别小心。
